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台灣己邁入創新導向的經濟發展階段，格局與視野應著眼於全球先進產業發展與產業升級，以提升國家競爭力，而創新研發實為提升競爭力的關鍵因素。故政府持續投入研發資源，透過科專計畫經費編列及技術處的統籌推動，希冀刺激民間研發風氣，帶動產業技術升級，提高我國競爭力。有鑑於此，鼓勵產業研發創新技術並創造產業價值，一直是技術處科專計畫所強調的重點。歷經十餘無的推動，科專計畫因應台灣產業各階段的發展，設計了不同政策工具及研究重點，同時有效整合產官學界各方研發資源。
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在台灣產業發展初期，一般企業研發資源有限，因此技術處規劃推動法人科技專案計畫（即法人科專），委託各財團法人研發機構，針對具策略性、前瞻性、或業界難以研發之技術進行研究，再將研究成果技術移轉、擴散至產業界，促進產業技術升級，目前法人科專仍是我國產業技術研發之主要能量來源之一。隨著我國產業技術研發能量逐漸累積，為進一步提升我國產業技術自主能力，技術處乃開放業界申請科專計畫（即業界科專）。而當新興國家快速崛起，我國技術創新及價值創造的強化儼然成為當務之急，為協助產業從技術追隨轉型為創新驅動，技術處進一步調整科專計畫，引進學界能量（即學界科專），積極鼓勵大學進行前瞻產業科技開發，讓學界多元化的研發資源彌補法人基礎研究之不足。
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科專計畫考量創新技術發展階段及需求的不同，依創新前瞻類科專、關鍵技術類科專、環境建構類科專三大類型屬性協助產業進行技術研發。其中創新前瞻類科專，主要定位在閒發國內外尚未商業化，但具有策略性願景或潛力，可在未來產業發展中導引策略性之產品、服務或技術之研發，促成台灣產業朝向價值創造邁進；關鍵技術類科專的重點則在針對未來產業發展所需、且業界難以研發之關鍵技術投入研發資源，突破產業發展瓶頸；除了上述兩類科專主要針對技術研發，另環境建構類科專，則以建置或維持檢測與認證設施、實驗室及試量產工廠，以及共通技術研發，強化產業長期發展所需之基礎能量與技術設備，及蒐集、研析相關之科技、經濟與法律等資訊。
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除亦配合經濟部「活力台灣、連結全球、高值產業、永續資源」施政願景，科專計畫之推動在電資通光、生技醫藥、機械運輸、材料化工等既有領域，持續深化關鍵技術的研發外積極發展跨領域技術整合、新興產業及創新科技應用等領域，期能厚實產業技術能量、傳統產業升級，達成以科技發展帶動國家經濟之目標，以及相關資源之分配。協助傳統產業升級，達成以科技發展帶動國家經濟之目標，以及相關資源之分配。
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2008科技專案執行年報
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| 科專計畫三大政策工具 |
| “活力台灣、連結全球、高值產業、永續資“以科技發展帶動國家經濟 |
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圖片說明：
- 法人科專（自1979）：電資通光領域、機電運輸領域、生技醫藥領域、材料化工領域、創新前瞻計畫
- 業界科專（自1999）：業界開發產業技術計畫、小型企業創新研發計畫、創新科技應用與服務技畫、鼓厲企業在台設立研發中心計畫
- 學界科專（自2001）：主題式創新研發產業技術研發中心、在地型產業加值型學界科專計畫
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